十二岁的米格住在墨西哥圣塞西莉亚一个小村庄，村裡洋溢著慶祝亡灵节的氣氛。米格的曾外曾外祖父（高祖父）为了实现音乐梦想，离乡背井、拋妻棄女，于是曾外祖母（高祖母）伊美黛就禁止李維拉一家（Riveras）后代接触音乐而從事製鞋家業[註 3]。然而，米格从小就梦想成为一名音乐家，就像他的偶像德拉库斯一样。德拉库斯是以《请记住我》一曲成名的流行歌手和电影明星[註 4]，但他不幸在1942年的演唱會现场发生意外被鐘給砸死。在亲戚里面，只有米格的曾外祖母可可不反对音乐，所以米格很喜欢她。米格无意发现亡灵节供桌上一张破损的照片有曾外祖母、高祖父母的合影，但是高祖父的脸被撕掉了。不过他察觉高祖父所持有的吉他是音乐家德拉库斯的，便深信高祖父就是歌神德拉库斯。大喜过望的米格拿着吉他告訴家人要参加选秀比赛，奶奶得知大发雷霆将吉他夺过来摔烂，米格為此傷心奪門而出。讓奶奶和全家人整夜都在瘋狂地去找他。
為了參加選秀比賽，米高把腦筋動到德拉古司的吉他上，偷偷潜入他的陵墓。拿起吉他轻弹了一下，突然就在现实世界消失、人们都看不到他，除了米格的朋友，一只流落街头的墨西哥無毛犬叫做丹丹（Dante）[註 5]。在墓地裡，米格遇到他死去的亲人都变成骷髅，他们很惊讶的看着米格，觉得米格的出现和梅尔达不能去现实世界有关，所以他把米格带到「亡灵之地」（Land of the Dead），一个死去的人生活的地方。只有在亡灵节的时候，已故的亲人才能去现实世界和生者团聚。
在亡灵之地，梅尔达、米格和他的亲人发现梅尔达不能去现实世界，是因为在亡灵节供奉的照片中梅尔达的肖像被米格從祭壇上取走並帶在身上。米格必须在日出前离开，否则他会变成骷髅永远待在那里。唯一能回到现实世界的方法，就是要有一片带着亲人祝福的万寿菊花瓣[註 6]；梅尔达同意让米格回家，但是条件是米格放弃自己的音乐梦想。米格回到陵墓不放棄依舊拿著吉他要去參加比賽，結果又回到亡灵之地，表明拒绝放弃音乐梦想而逃离。随后米格巧遇埃克托，一心想到现实世界中的人。米格声称德拉库斯是他唯一的亲人，埃克托同意帮助他找到德拉库斯，米格就可以继续坚持自己的梦想；交换條件是、米格同意把埃克托的照片放在他家供桌当中，这样他就可以通过连接亡灵之地和现实世界中的桥。
接近德拉库斯的方法是参加音乐比赛，奖品是德拉库斯的宫殿入场券。埃克托要从他的朋友齊恰龍那里借吉他，好让米格参赛。埃克托從齊恰龍口中得知他沒有親戚可以記住他，很快地要在亡灵之地永久消失，齊恰龍要求埃克托陪他最後合唱他喜歡的歌曲來換取吉他作為條件。埃克托與齊恰龍合唱之後，齊恰龍答應把吉他借給埃克托然後跟他擁抱不久然後就消失了，米格發現齊恰龍消失後，他才知道如果亡灵在现实世界中所有人遗忘它的时候就會真正的消失。不過他同意在比賽中用齊恰龍的吉他來改變埃克托的命運。埃克托把米格的脸画成了骷髅的形状，这样他就可以自由行走在城市而不被家人发现。最終他们赢得了音乐比赛。但同时梅尔达靠著她的靈獸南瓜籽（Pepita）也跟蹤著米格[註 7]。埃克托发现米格可以随时回到现实世界，他要求米格回亲戚那里而发生争论。为此米格离开埃克托和丹丹决心独自潜入德拉库斯的宫殿去找德拉库斯。
在宫殿的米格告诉德拉库斯，他就是其玄孙。德拉库斯欢迎米格的到来，要给他带有祝福的万寿菊花瓣时，埃克托也潜入宫殿透露他曾是著名的歌手和作曲家，是德拉库斯的搭档。宮殿螢幕播放著似曾相識的片段，讓埃克托回想起他去世的那天决定放弃音乐产业与家人在一起，可是德拉库斯卻愤而毒殺埃克托還偷走他的歌曲和吉他藉此成名。德拉库斯把埃克托的照片收进上衣口袋，並派人把埃克托和米格推進一个巨大的洞穴湖泊中。
在洞穴裡，米格意识到家人的目的并希望与他们和解；埃克托則道出他想过桥的主要原因是再次看到女儿可可，米格終於知道埃克托其實就是他真正的高祖父與偶像。他從埃克托口中得知唯一还记得埃克托的健在者可可的记忆力正在衰退，埃克托开始逐渐消失，如果埃克托在太阳升起時仍無法讓可可記得他，他就会永远消失。在丹丹的帮助下，梅尔达驾着南瓜籽发现米格、和埃克托重逢；且丹丹因幫助米格他們脫困也變成了靈獸。米格说服梅尔达和她的家人来帮助他从德拉库斯身上抢到埃克托的照片，然後把所有的真相全部都說出來。伊美黛與她的家人獲得真相後決定幫助米格從德拉库斯手上奪回埃克托的照片，在米格一夥人成功闖入德拉库斯的演唱會，伊美黛試圖拿回埃克托的照片卻陰錯陽差在德拉古司的舞台上演唱可是卻失败了。現場轉播中憤怒的德拉古司把米哥從高處丟下(此場面也間接讓觀眾親眼目睹了德拉古司的惡劣本性)，所幸南瓜籽救回米高，不过埃克托的照片卻掉进洞穴湖里。不知早已被米高的祖先們，合力將自身惡行公诸于世的德拉库斯重返舞台時被粉丝給唾弃，南瓜籽發威將德拉古司踹去撞宮殿的大鐘，德拉古司如生前般再次被大鐘砸在他身上令現場歡聲雷動。
但是太阳缓缓升起，埃克托开始慢慢消失。埃克托要求米格讓他的女兒可可永远都不会忘记他，米格向埃克托承诺要让可可永远会記得他。然后梅尔达送米格回圣塞西莉亚。回到现实世界后，米格拿起原属埃克托的吉他跑回家让迟钝的曾祖母可可回忆起埃克托然後含泪弹唱歌曲《勿忘我》。这是埃克托曾深情献给他的女儿可可的歌曲，觸發可可的記憶而跟着唱起來，可可從抽屜取出一個信封袋，裡面内有合照中埃克托缺失的脸那一角，她和米格分享她对爸爸埃克托的一些回忆，讓一家大團圓和解。
一年之后的亡灵节，米高向家族新成員小妹介绍先人，当中也有已故的曾祖母可可。由於可可保存家書有德拉古司偷走埃克托作品的關鍵證據，德拉古司受到世人貼上忘記你（Forget you）的牌子鄙棄，而埃克托獲得平反。在亡灵之地的埃克托和她的女儿可可一家通过菊瓣桥和亲人团聚，米高為在世及已逝親人彈唱，丹丹和貓咪型態的南瓜籽都是米哥家庭的一分子，故事完美結束。