喜鹊的孵蛋过程从雌鸟产卵后开始，由雌雄亲鸟共同参与，但以雌鸟为主。筑巢完成后，雌鸟会在巢内产下5-8枚卵，随后开始孵化，雄鸟则承担觅食和警戒任务，守护在巢穴附近，避免天敌靠近。孵化期约17-18天，期间雌鸟会用腹部的孵卵斑（繁殖期形成的裸露皮肤区域）紧贴卵，通过体温为卵提供孵化所需的温度。
孵蛋时，雌鸟会频繁调整卵的位置，用喙轻轻翻动卵，使每个卵受热均匀，确保胚胎正常发育。每天雄鸟会多次飞回巢穴，将捕捉到的昆虫、浆果等食物递给雌鸟，雌鸟短暂进食后继续孵蛋，减少离巢时间。若遇到恶劣天气（如暴雨、低温），雄鸟会在巢边停留更久，有时甚至与雌鸟共同护卵，增强对卵的保护。
临近孵化结束时，雏鸟会在卵内用“卵齿”啄破蛋壳，雌鸟会协助清理蛋壳碎片，避免碎片划伤幼鸟。刚出壳的幼鸟软弱无力，全身几乎无毛，眼睛未睁开，完全依赖亲鸟喂养。此时孵蛋阶段结束，亲鸟进入育雏期，开始轮流外出觅食，将食物带回巢穴喂食幼鸟，直至幼鸟能够独立生活。整个孵蛋过程体现了喜鹊的繁殖智慧和亲鸟对后代的照料本能。